Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms