Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms