Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL38Q2WGJ6 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms