Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KNOP1Q1ED39 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KNOP1Q1ED39 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms