Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATP6V1FQ16864 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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