Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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