Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK4Q16099 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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