Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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