Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCOA1Q15788 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms