Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TAF1AQ15573 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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TAF1AQ15573 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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TAF1AQ15573 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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TAF1AQ15573 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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TAF1AQ15573 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TAF1AQ15573 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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