Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SIX1Q15475 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIX1Q15475 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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