Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.417e-9■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.383e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 EIF4A1-222ENST00000582050 576 ntTSL 517.38■□□□□ 0.373e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 AKT2-225ENST00000496089 982 ntTSL 517.16■□□□□ 0.343e-15■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.33e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.233e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.233e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 NADK-203ENST00000342348 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.35■□□□□ 0.217e-9■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.23e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.163e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 EIF4A1-207ENST00000578324 1577 ntTSL 515.87■□□□□ 0.133e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 RAD52-205ENST00000461568 1531 ntTSL 1 (best)15.87■□□□□ 0.133e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 DNAJC8-205ENST00000489277 1600 ntTSL 1 (best)15.6■□□□□ 0.094e-7■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.067e-9■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.037e-9■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 03e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 RAD52-210ENST00000535376 808 ntTSL 315□□□□□ -0.013e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 ENTPD5-204ENST00000555829 691 ntTSL 315□□□□□ -0.013e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 SCML1-205ENST00000419185 817 ntTSL 314.69□□□□□ -0.063e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 MAU2-205ENST00000586189 590 ntTSL 514.6□□□□□ -0.073e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.13e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.17e-9■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 PNPLA3-202ENST00000406117 1480 ntTSL 214.36□□□□□ -0.117e-9■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.123e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 PMM1-205ENST00000472620 1576 ntTSL 514.25□□□□□ -0.133e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 EIF4A1-228ENST00000583389 951 ntTSL 314□□□□□ -0.173e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 PMM1-208ENST00000485648 1405 ntTSL 513.81□□□□□ -0.23e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.23e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 RAD52-208ENST00000481052 2464 ntTSL 213.75□□□□□ -0.213e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.213e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.213e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.243e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 PRCC-202ENST00000454659 1084 ntTSL 313.51□□□□□ -0.253e-14■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.257e-9■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.283e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.33e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 RAD52-216ENST00000543912 1243 ntTSL 1 (best)13.16□□□□□ -0.33e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.317e-9■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 ANKRD12-204ENST00000540578 1338 ntTSL 1 (best)13.06□□□□□ -0.323e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 RAD52-206ENST00000463750 1510 ntTSL 213.02□□□□□ -0.333e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 RAD52-207ENST00000468231 2499 ntTSL 212.95□□□□□ -0.343e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 MSRA-202ENST00000382490 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.343e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 SCML1-201ENST00000380041 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.363e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 PMM1-207ENST00000482178 2020 ntTSL 212.76□□□□□ -0.373e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.47e-9■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.423e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 RAD52-209ENST00000488642 2413 ntTSL 212.04□□□□□ -0.483e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 SCML1-204ENST00000398080 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.493e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.517e-9■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 ATG7-202ENST00000354956 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.567e-9■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 NADK-204ENST00000378625 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.67e-9■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 PRCC-207ENST00000526188 634 ntTSL 211.19□□□□□ -0.623e-14■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 RAD52-204ENST00000430095 2366 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.633e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 TBCK-215ENST00000509532 848 ntTSL 511.08□□□□□ -0.643e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 PNPLA3-205ENST00000497129 422 ntTSL 511.06□□□□□ -0.647e-9■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 TBCK-204ENST00000394708 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.653e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 CBR4-207ENST00000510042 1198 ntTSL 210.95□□□□□ -0.663e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 SCML1-202ENST00000380043 2830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.753e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 TBCK-213ENST00000507696 579 ntTSL 510.21□□□□□ -0.773e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 MSRA-210ENST00000528246 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.783e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 RAD52-202ENST00000358495 2710 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.813e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 KDELR2-205ENST00000463747 376 ntTSL 59.82□□□□□ -0.843e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 RAD52-201ENST00000228345 2826 ntTSL 29.74□□□□□ -0.853e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 EIF4A1-221ENST00000581841 621 ntTSL 29.7□□□□□ -0.863e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 KDELR2-202ENST00000382267 583 ntTSL 49.63□□□□□ -0.873e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 TBCK-202ENST00000361687 3312 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.93e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.963e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 MAP7D2-205ENST00000466145 598 ntTSL 28.93□□□□□ -0.983e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 TBCK-203ENST00000394706 3349 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.983e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 PPRC1-206ENST00000495914 564 ntTSL 28.83□□□□□ -13e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.023e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 TBCK-201ENST00000273980 8101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.043e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 MSRA-205ENST00000518255 674 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.043e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.083e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 TBCK-206ENST00000467183 3566 ntTSL 1 (best)8.27□□□□□ -1.083e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 SCML1-206ENST00000427362 846 ntTSL 58.02□□□□□ -1.133e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 DNAJC8-206ENST00000603289 483 ntTSL 57.67□□□□□ -1.184e-7■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 SCML1-203ENST00000380045 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.213e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 KDELR2-204ENST00000462052 382 ntTSL 27.37□□□□□ -1.233e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 AKT2-215ENST00000476247 488 ntTSL 37.14□□□□□ -1.273e-15■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 MSRA-209ENST00000523637 1092 ntTSL 27.06□□□□□ -1.283e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.393e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 BAG4-204ENST00000521311 719 ntTSL 26.32□□□□□ -1.43e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.423e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.63□□□□□ -1.513e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.533e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 SCML1-207ENST00000487842 4615 ntTSL 1 (best)5.45□□□□□ -1.543e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 MSRA-208ENST00000522907 871 ntTSL 55.17□□□□□ -1.583e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 ATG7-212ENST00000446110 435 ntTSL 35.11□□□□□ -1.597e-9■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 ANKRD12-205ENST00000546007 978 ntTSL 54.62□□□□□ -1.673e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 CBR4-206ENST00000509108 546 ntTSL 34.02□□□□□ -1.773e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 TBCK-216ENST00000509862 600 ntTSL 43.41□□□□□ -1.863e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 ANKRD12-202ENST00000359158 2250 ntTSL 22.85□□□□□ -1.953e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.854e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.84e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.044e-6■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 FGFR1-223ENST00000496296 1898 ntTSL 1 (best)20.75■□□□□ 0.914e-7■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 FGFR1-217ENST00000470826 2281 ntTSL 1 (best)20.6■□□□□ 0.894e-7■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 FGFR1-205ENST00000397090 777 ntTSL 220.54■□□□□ 0.884e-7■■□□□ 12.5
PCBP2Q15366 FGFR1-210ENST00000413133 587 ntTSL 414.55□□□□□ -0.084e-7■■□□□ 12.5
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