Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC055748.1-201ENST00000489836 959 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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