Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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