Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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