Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL4AQ13619 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms