Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ATRQ13535 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 RBFOX1-214ENST00000552089 1430 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ATRQ13535 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ATRQ13535 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
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