Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMAD4Q13485 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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