Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TOP3AQ13472 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms