Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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