Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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FOXC1Q12948 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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FOXC1Q12948 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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FOXC1Q12948 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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FOXC1Q12948 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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FOXC1Q12948 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
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FOXC1Q12948 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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