Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms