Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EP300Q09472 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EP300Q09472 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
EP300Q09472 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EP300Q09472 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EP300Q09472 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EP300Q09472 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EP300Q09472 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EP300Q09472 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EP300Q09472 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EP300Q09472 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EP300Q09472 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EP300Q09472 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EP300Q09472 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EP300Q09472 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EP300Q09472 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
EP300Q09472 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
EP300Q09472 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EP300Q09472 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
EP300Q09472 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
EP300Q09472 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EP300Q09472 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EP300Q09472 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EP300Q09472 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EP300Q09472 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EP300Q09472 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EP300Q09472 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EP300Q09472 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EP300Q09472 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
EP300Q09472 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
EP300Q09472 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.15
EP300Q09472 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
EP300Q09472 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EP300Q09472 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EP300Q09472 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EP300Q09472 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
EP300Q09472 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EP300Q09472 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EP300Q09472 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms