Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNA1Q09470 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms