Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC8Q09428 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC8Q09428 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC8Q09428 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC8Q09428 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC8Q09428 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC8Q09428 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC8Q09428 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC8Q09428 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC8Q09428 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC8Q09428 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC8Q09428 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC8Q09428 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC8Q09428 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC8Q09428 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC8Q09428 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC8Q09428 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC8Q09428 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC8Q09428 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC8Q09428 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC8Q09428 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC8Q09428 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC8Q09428 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCC8Q09428 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCC8Q09428 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms