Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA3Q08378 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms