Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms