Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms