Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP54P61011 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP54P61011 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP54P61011 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP54P61011 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP54P61011 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP54P61011 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP54P61011 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP54P61011 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP54P61011 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP54P61011 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP54P61011 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP54P61011 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP54P61011 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP54P61011 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP54P61011 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP54P61011 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP54P61011 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP54P61011 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP54P61011 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP54P61011 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP54P61011 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP54P61011 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP54P61011 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRP54P61011 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRP54P61011 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRP54P61011 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SRP54P61011 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRP54P61011 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRP54P61011 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRP54P61011 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRP54P61011 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRP54P61011 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRP54P61011 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRP54P61011 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRP54P61011 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRP54P61011 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRP54P61011 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRP54P61011 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRP54P61011 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SRP54P61011 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRP54P61011 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRP54P61011 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRP54P61011 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRP54P61011 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRP54P61011 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRP54P61011 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRP54P61011 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRP54P61011 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRP54P61011 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRP54P61011 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRP54P61011 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SRP54P61011 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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