Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms