Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

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Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CTBP2P56545 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CTBP2P56545 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CTBP2P56545 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CTBP2P56545 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTBP2P56545 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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