Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms