Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMD8P48556 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMD8P48556 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PSMD8P48556 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMD8P48556 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PSMD8P48556 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMD8P48556 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMD8P48556 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMD8P48556 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMD8P48556 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMD8P48556 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMD8P48556 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMD8P48556 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PSMD8P48556 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMD8P48556 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMD8P48556 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMD8P48556 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMD8P48556 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMD8P48556 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMD8P48556 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMD8P48556 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMD8P48556 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMD8P48556 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMD8P48556 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PSMD8P48556 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMD8P48556 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMD8P48556 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMD8P48556 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMD8P48556 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMD8P48556 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMD8P48556 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMD8P48556 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMD8P48556 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMD8P48556 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMD8P48556 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMD8P48556 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMD8P48556 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMD8P48556 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMD8P48556 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMD8P48556 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMD8P48556 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMD8P48556 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMD8P48556 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMD8P48556 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMD8P48556 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMD8P48556 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMD8P48556 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMD8P48556 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms