Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATRXP46100 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ATRXP46100 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ATRXP46100 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AC139887.2-201ENST00000503571 531 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATRXP46100 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AC239600.1-201ENST00000603201 462 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AC021072.1-201ENST00000635789 835 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 GZMH-201ENST00000216338 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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