Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTN2P35609 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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