Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms