Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP1P29466 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP1P29466 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP1P29466 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP1P29466 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP1P29466 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP1P29466 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP1P29466 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP1P29466 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP1P29466 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP1P29466 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP1P29466 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP1P29466 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP1P29466 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP1P29466 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP1P29466 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP1P29466 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP1P29466 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP1P29466 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP1P29466 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP1P29466 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP1P29466 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP1P29466 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP1P29466 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP1P29466 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP1P29466 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP1P29466 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP1P29466 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP1P29466 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP1P29466 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP1P29466 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP1P29466 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP1P29466 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP1P29466 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP1P29466 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP1P29466 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP1P29466 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP1P29466 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP1P29466 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP1P29466 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP1P29466 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP1P29466 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP1P29466 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP1P29466 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP1P29466 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP1P29466 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP1P29466 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP1P29466 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP1P29466 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP1P29466 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP1P29466 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms