Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB4P28070 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB4P28070 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms