Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PTPRBP23467 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PTPRBP23467 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PTPRBP23467 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PTPRBP23467 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PTPRBP23467 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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PTPRBP23467 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PTPRBP23467 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PTPRBP23467 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PTPRBP23467 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PTPRBP23467 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PTPRBP23467 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PTPRBP23467 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PTPRBP23467 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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