Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms