Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP4AP20648 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms