Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 LDHAL6CP-201ENST00000502352 1142 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRHP20396 FAM153C-208ENST00000511189 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRHP20396 ROPN1L-AS1-201ENST00000513037 189 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRHP20396 TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 562 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRHP20396 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRHP20396 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRHP20396 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRHP20396 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRHP20396 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRHP20396 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRHP20396 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRHP20396 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRHP20396 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRHP20396 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRHP20396 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRHP20396 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRHP20396 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRHP20396 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRHP20396 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRHP20396 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRHP20396 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRHP20396 RAB8A-202ENST00000586682 1315 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRHP20396 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRHP20396 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRHP20396 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRHP20396 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRHP20396 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRHP20396 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRHP20396 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRHP20396 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRHP20396 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRHP20396 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRHP20396 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRHP20396 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRHP20396 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRHP20396 AC012066.1-201ENST00000439252 694 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRHP20396 AC012513.2-201ENST00000441511 1137 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRHP20396 SRP9P1-201ENST00000445874 261 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRHP20396 AC007405.2-203ENST00000455988 547 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRHP20396 MIR583HG-201ENST00000507997 704 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRHP20396 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRHP20396 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRHP20396 C3orf84-203ENST00000545770 706 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRHP20396 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRHP20396 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRHP20396 AC010551.3-201ENST00000563772 463 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRHP20396 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRHP20396 AL121992.3-201ENST00000606186 346 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRHP20396 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRHP20396 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRHP20396 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRHP20396 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRHP20396 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRHP20396 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRHP20396 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRHP20396 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRHP20396 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRHP20396 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRHP20396 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 CAV2-202ENST00000343213 776 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 SUGT1-202ENST00000343788 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 AL049792.1-201ENST00000424708 1262 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 RN7SL677P-201ENST00000466970 319 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 AP003170.2-201ENST00000544730 786 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 TUBB4A-207ENST00000596926 548 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 UBA52-213ENST00000599551 707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 SDHD-214ENST00000614349 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 AC116631.1-201ENST00000640685 576 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 RNF4-216ENST00000511859 1373 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRHP20396 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
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