Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDCP19113 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDCP19113 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDCP19113 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDCP19113 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDCP19113 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDCP19113 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDCP19113 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDCP19113 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms