Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms