Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCP1P17987 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TCP1P17987 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TCP1P17987 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TCP1P17987 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCP1P17987 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCP1P17987 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCP1P17987 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TCP1P17987 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCP1P17987 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TCP1P17987 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TCP1P17987 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCP1P17987 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCP1P17987 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCP1P17987 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCP1P17987 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCP1P17987 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCP1P17987 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCP1P17987 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCP1P17987 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCP1P17987 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCP1P17987 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCP1P17987 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCP1P17987 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCP1P17987 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCP1P17987 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCP1P17987 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms