Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms