Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 LMO7DN-201ENST00000318245 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 WDYHV1-201ENST00000287387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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HOXB3P14651 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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HOXB3P14651 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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HOXB3P14651 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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HOXB3P14651 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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HOXB3P14651 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 NSMCE2-208ENST00000520866 1183 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB3P14651 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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