Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNAP12004 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNAP12004 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNAP12004 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNAP12004 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNAP12004 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNAP12004 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNAP12004 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNAP12004 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNAP12004 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNAP12004 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNAP12004 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNAP12004 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNAP12004 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNAP12004 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNAP12004 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNAP12004 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNAP12004 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNAP12004 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNAP12004 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNAP12004 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNAP12004 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNAP12004 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNAP12004 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCNAP12004 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNAP12004 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNAP12004 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNAP12004 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNAP12004 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNAP12004 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNAP12004 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNAP12004 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNAP12004 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNAP12004 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNAP12004 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNAP12004 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNAP12004 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNAP12004 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNAP12004 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNAP12004 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNAP12004 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNAP12004 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNAP12004 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNAP12004 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNAP12004 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNAP12004 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNAP12004 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNAP12004 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNAP12004 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNAP12004 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNAP12004 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNAP12004 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNAP12004 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNAP12004 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNAP12004 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNAP12004 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNAP12004 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNAP12004 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNAP12004 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNAP12004 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNAP12004 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNAP12004 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNAP12004 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNAP12004 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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