Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM58BPP0C7Q3 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms