Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms